Pesantren Sains (Sansai) merupakan program pembelajaran terpadu meliputi bidang studi agama, ekonomi-kewirausahaan, bahasa, sejarah, sosiologi, dan kepemimpinan; dilaksanakan setiap Ramadhan selama 5-6 hari di luar kota Bandung.
Dalam program ini para siswa melakukan penelitian atau survei langsung ke berbagai objek di berbagai tempat, seperti bertani tanaman tembakau, usaha dodol dan ternak domba, industri rotan, bordir, batik, peci, lampu gentur, bahasa daerah, perkembangan sejarah islam, dsb. Selain itu para siswa juga memperoleh materi-materi pengembangan dinul Islam secara intensif dan tematik, yang digali dari Al quran dan Sunnah, baik di dalam ruangan ataupun di alam.
Kegiatan Sansai bertujuan untuk:
1) meningkatkan kualitas keimanan dan ketaqwaan kepada Alloh SWT;
2) meningkatkan kualitas kepribadian siswa sebagai seorang muslim;
3) menumbuhkan jiwa kemandirian dan kewirausahaan;
4) meningkatkan kepekaan dan kepedulian sosial siswa.
“Apabila kamu telah tunaikan sholat, maka bertebaranlah kamu di muka bumi dan carilah karunia Alloh…(Al Jumuah:11)”